在整个微燃机能源岛系统中，存在很多控制环节，主要包括燃气轮机的转速控制系统、透平入口温度控制系统、直燃机和余热锅炉的负荷或温度控制系统、各种流量给定及其控制系统等。这些控制系统如果采用模拟方式给出，每一项都相当于一个模拟控制器，不但实现困难，也使得模拟电路变得异常复杂，而且控制效果和精度都不能很好地得到满足。实际上，目前的控制过程在实际的物理系统中大多都是采用数字控制方式实现的，因此，采用数字控制仿真恰好符合了实际系统。

　　以转速和燃料控制为例，对于微型燃气轮机来说，当合理地补偿回热器的滞后作用后，采用PI（或PID）控制能够得到很好的动态过渡品质，其控制关系为：XB=-Xn（ Tss）WT（s），式中，XB、Xn分别是对燃料流量和转速的相对增量的拉氏变换；为调节机构的放大倍数；Ts为调速器积分时间常数，WT（s）是回热器校正环节，它与回热器的时间常数和滞后作用有关。式中的放大倍数和时间常数Ts的合理整定关系到机组的控制品质，是控制优化的主要参数，也是控制功能扩展的主要变量。

　　微型燃气轮机的仿真启动过程是微型燃气轮机的一个主要控制过程，一般的要求是启动过程时间足够短，而且透平入口温度以及机组各部件的温度变化要在材料热应力允许的条件下，同时还要考虑压气机的喘振等因素。因此，不同的机组都有适合于自身的启动方式启动曲线。考虑到系统的通用性，一般要建立尽可能多的启动方式，但这些启动方式一般都是多参数耦合曲线，应用模拟方法不易实现。